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Classes
		CSVParser   class CSVParser     Reads a csv file of the format ID_REF, IDENTIFIER, SAMP1Name, SAMP2Name, ... ,SAMPnName prob1_id, gene1_id, g1S1val, g1S2val, ... , g1Snval ... probm_id, genem_id, gmS1val, gmS2val, ... , gmSnval     Methods defined here: __init__(self, filename, probe_column_name='ID_REF', gene_column_name='IDENTIFIER') getColumnHeadings(self) Returns a list of the column headings (the first line of the csv file) getColumnHeadingsInfo(self) Not really applicable, but added for compatibility with softparser getData(s) Called automatically by constructor. Parses the csv file getDataColumnHeadings(self) Returns the data column headings getIDENTIFIER(self) This is not guaranteed to be there, but so far it has been. If it is not available we will have to handle it somehow. Probably just set identifier_label to ID_REF This should map to genes and each value will not be unique. getID_REF(self) Returns the probe column getKeyColumnHeadings(self) Returns the key column headings getTable(self, lock=False) Returns the table. If you want to operate directly on the table, set lock to True. setGeneColumnName(self, gene_column_name='IDENTIFIER') Sets the name of the gene column setProbeColumnName(self, probe_column_name='ID_REF') Sets the name of the probe column.